針對近期民進黨立委蔡易餘主張修法廢除特偵組，且法務部傾向廢除的情形，國家政策研究基金會今（19）日召開記者會強調，堅決反對廢除特偵組，並指出特偵組具備「偵辦特殊案件」、「獨立運作」、「不分黨派偵辦」、「不受政治力影響」等優點。
孫立群受訪時強調，特偵組的成立是由前民進黨立委蔡啟芳所提，但諷刺的是，現在竟是由蔡啟芳的公子蔡易餘要提案廢除特偵組。
孫立群質疑，由此可見目前現任立法委員，對於當初的提案、立法意旨，甚至整個組織的發展「是沒有做功課了解的」，他表示，國民黨對於這樣的立法品質感到非常遺憾，也認為此種風氣不可以存在。
而對於外界質疑特偵組「辦綠不辦藍」的說法，孫立群則反批，這是他們一貫「抹黑、亂七八糟且胡說八道」的說法，他指出，其實民眾上特偵組網站就可以看到，特偵組所偵辦的案件中「是辦綠也辦藍」的。
孫立群認為，會有「辦綠不辦藍」說法的主因，應是特偵組前陣子將馬英九的部分案子簽結，而這當然就是「政治不正確」的做法，才可能會讓執政黨有「既然我無法掌控你，我乾脆就把你宰了吧」的想法。