海基會董事長人事難定，許信良、宋楚瑜、王金平被列為可能人選，其中王金平呼聲最高，不過卻有國民黨立委認為，若王接海基會董事長，應辭去立委一職，國民黨黨主席洪秀柱則認為，傳聞沒有證實，不需太早提處分，為王緩頰，對於王出任海基會董事長一職，陸媒認為，將動搖國民黨翻身的機會。 《中評社》一篇社評提到，蔡英文打出王金平這張王牌，既能分裂本土藍，又丟給洪秀柱是否同意王兼任立委、停止黨籍，或開除等難題，不過親王派認為，海基會屬民間團體，並非入閣，和王立委的身分無衝突，更無黨紀處分等問題，凸顯王以立委身分接任海基會機會較大。 社評認為，王接海基會將造成兩大衝擊，一是瓦解本土藍、二是兩岸政策方向，王金平效應將帶動一批人與綠營謀合，本土藍路線上會趨近綠營，導致藍綠失衡越來越嚴重，洪秀柱面臨嚴峻的挑戰。在兩岸政策上，王金平勢必會以蔡英文不承認九二共識立場，去執行兩岸交流任務，假如國民黨支持王金平以黨員身分，去執行不承認九二共識的兩岸交流，那國民黨深化九二共識為主軸的兩岸政策，形同倒台，對國民黨殺傷力大。 社評稱讚蔡英文高招，藉此摧毀國民黨想以兩岸政策翻身的機會，國民黨也對王金平束手無策，若洪秀柱硬拔掉王，可能還重蹈馬王戰爭覆轍，但對於前民進黨立委林濁水認為「王金平絕對是北京的黑名單」說法感到匪夷所思。