2016大選，民進黨奪下立法院68席，成功贏得國會過半，有望搶下立法院正副院長，民進黨內爭取國會龍頭競爭激烈，而民進黨黨團總召柯建銘呼聲最高，王金平即將卸任17年來立法院長一職，柯建銘接受媒體專訪認為，朝野還是該給王金平最大禮遇，不過隨著王卸任倒數，卻爆發被黨內逼退、昔日心腹林錫山涉貪收押，柯建銘坦言「王金平在政治判斷上出了很大的問題」。 柯建銘接受《壹週刊》專訪，爆料王金平曾動念選總統，當時王金平曾私下跟他透露「若我跟蔡英文選總統，最後不論誰當選，都是本土派做總統。」不過王金平最後卻退縮了，柯建銘認為，王在國會擁有泛藍陣營多數黨的優勢，如果要選總統，就該勇敢做出決定，否則也可回去做區域立委，但他卻在在重大時刻猶豫不決，失去機會。 國民黨選舉空前挫敗，王金平卸任倒數又遭反王人馬逼退，逼辭退立委職務，選後三天又爆發立法院秘書長林錫山涉嫌收賄，柯建銘認為，王應在選舉結束後，就辭去不分區，如今爆發林錫山事件，王金平已超過最佳的辭職時機點，現在辭去反而惹議，柯建銘感嘆王金平在政治判斷出了很大問題，不過柯也喊話，未來大家還是要打從心底尊敬王金平，朝野應給他最大禮遇。